Ученые использовали метод сверхчувствительной микроскопии, чтобы впервые получить изображения пространственной организации отдельных участков хроматина, а также выяснить особенности формирования 3D структуры в зависимости от эпигенетического влияния. Для этого в клетках дрозофилы были исследованы 46 геномных домена — участков с различным эпигенетическим статусом: с активной транскрипцией генов, неактивные и подавленные. Эпигенетический статус определялся на основе гистонных модификаций и регуляторных белков, связывающихся с доменом. Например, если домен преимущественно связывался с белками группы polycomb, ответственными за ингибирование множества генов, его относили к третьей группе. Для каждого домена выяснялись особенности пространственной организации, например, занимаемый им объем, длина, плотность упаковки и другие параметры.
Исследователи выяснили, что существует четкая зависимость между определенным эпигенетическим статусом домена и свойствами его 3D структуры. Объем активных доменов был всегда больше объема подавленных. Для активных доменов зависимость объема от длины всегда положительная, а для подавленных — отрицательная, то есть чем длиннее ДНК, тем она плотнее упакована.
Читать дальше.
Комментарии:
Авторизуйтесь, чтобы оставить отзыв