При пользовании системой, созданной сотрудниками Гарвардской медицинской школы с коллегами, РНК бактерий экстрагируется с помощью одноразового картриджа. Затем ее усиливают методом ПЦР с ассиметричной обратной транскрипцией и смешивают с аналитическим раствором. Этот раствор содержит два компонента: «ключ», который состоит из последовательности ДНК, комплементарной бактериальной нуклеиновой кислоте, и специфичного к ДНК-полимеразе аптамера, а также репортерной ДНК с флуорофором.

При нахождении в растворе генетического материала искомой бактерии ключ инактивирует ДНК-полимеразу и стабилизирует репортерную ДНК, которая приобретает высокую флуоресцентную анизотропию из-за медленного диффузионного движения. В отсутствие бактериальных нуклеиновых кислот анизотропия низка, поскольку ДНК-полимераза высвобождает флуорофор.

Весь процесс происходит в компактной системе с четырьмя двухсантиметровыми кубическими пластиковыми емкостями для раствора и подложкой-детектором. Управление системой и прием данных проводятся со смартфона, подключенного по Bluetooth. Весь процесс диагностики занимает около двух часов.

Читать дальше.