Исследование таксономической структуры почвенного и ризосферного микробиомов различных сортов Triticum aestivum (Пшеница мягкая) и Secale cereale (Рожь посевная), культивируемых в двух типах почв

Разнообразие микроорганизмов, ассоциированных с корнями растений, огромно и составляет десятки тысяч видов. Современные молекулярно-биологические методы анализа биоразнообразия микробных сообществ, в первую очередь метагеномный анализ, сделали возможным исследование структуры ризосферных микробиомов во всей ее полноте с учетом не только культивируемых, но и некультивируемых форм микроорганизмов. Данная работа посвящена исследованию таксономической структуры почвенного и ризосферного микробиомов двух сортов Triticum aestivum (Пшеница мягкая) и двух сортов Secale cereale (Рожь посевная), культивируемых в черноземной и дерново-подзолистой почвах, посредством пиросеквенирования амплифицированных фрагментов гена 16S рРНК. Был произведен расчет основных показателей биоразнообразия для исследуемых сообществ. Наблюдалась тенденция к снижению индексов видового богатства и Шеннона в почве ризосферы растений по сравнению с контрольными образцами почвы, однако достоверные различия в показателях разнообразия были выявлены только для ризосфер пшеницы на черноземной почве. В ходе сравнительного анализа микробиомов ризосферы и контрольных почв было показано, что определяющим фактором при формировании таксономической структуры сообществ ризосферы является тип почвы. В меньшей степени на состав ризосферного микробиома влияют такие факторы как вид и сорт культивируемого растения. В работе также рассматривается проблема воспроизводимости данных пиросеквенирования и даются рекомендации по увеличению числа повторностей опыта в зависимости от типа исследуемой почвы – для черноземных почв число повторностей должно быть увеличено с 4 до, по меньшей мере, 7, а в случае дерново-подзолистой – до 5-6 повторностей. Были выявлены группы бактерий, доля которых достоверно не изменялась в повторностях опыта. Среди этой группы были идентифицированы таксоны, достоверно изменяющие свою численность в ризосфере растений по сравнению с контрольными образцами почвы, среди них бактерии из таких семейств как Gaiellaceae ,Oxalobacteraceae, Micrococcaceae, Comamonadaceae. Также был обнаружен ряд представителей филы Acidobacteria, в том числе некультивируемых и ранее неидентифицируемых бактерий из класса Acidobacteria-6,увеличивающих свою численность в ризосфере ржи и пшеницы, культивируемых на черноземе, а также в ризосфере пшеницы, культивируемой на дерново-подзолистой почве.

Биология
Дипломы

Вуз: Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ)

ID: 587d36585f1be77c40d58d32
UUID: 92c35a84-e592-4134-9a05-dac56a87bf95
Язык: Русский
Опубликовано: больше 4 лет назад
Просмотры: 49

Серикова Елена Николаевна

Источник: Санкт-Петербургский государственный университет


0

Комментировать 0

Рецензировать 0

Скачать - 1062817 bytes


Поделиться работой
Current View

Рецензии:

  Авторизуйтесь, чтобы добавить рецензию

- у работы пока нет рецензий -

Для лиц старше 18 лет